3 сезон сериала глубже погружается во тьму и хаос мира «Ведьмака», а также более тесно соответствует сюжету оригинальных книг Анджея Сапковского. Хотя это и не прямая адаптация, он призван удовлетворить поклонников, включив в него основные события и ключевых персонажей из романов. Основанный на романе «Час презрения», сезон рассказывает о назревающей войне с Нильфгаардом, в которой император Эмгыр остается на шаг впереди своих соперников благодаря сети шпионов. Йеннифэр, зная о могущественных способностях Цири и чувствуя к ней материнскую связь, решает отправить ее в волшебную школу Аретузы на острове Танедд. Однако Цири восстает против этой идеи и намеревается найти Геральта. Когда они воссоединяются, напряжение и эмоции между Йеннифэр и Геральтом всплывают на поверхность, что приводит их к созданию нетрадиционной семьи с Цири. События принимают драматический оборот во время конгресса чародеев, где присутствие Йеннифэр нарушает их планы. Геральт тяжело ранен колдуном Вильгефорцем, но спасен жителями Брокилонского леса и позже найден Одуванчиком. Тем временем Цири, спасаясь через волшебный портал, теряет свои силы и попадает в руки охотников за головами, начиная новую и сложную главу в своей жизни.